Se você não tiver feito nenhuma modificação nos códigos do jogo, acredito que basta mandar o arquivo modificado, que ele será compatível com o save da última versão.
Exemplo: Você modifica o mapa de ID 50, então basta mandar para os jogadores o arquivo Map050.rvdata2 modificado.
É recomendável que o save não esteja no mapa modificado. Fora isso, acho que tudo dá certinho.
Se você tiver modificado algo nos códigos do jogo, dai acho que não tem jeito, você pode mandar só o arquivo modificado mesmo (Scripts.rvdata2 nesse caso), mas o jogador terá que recomeçar o jogo muito provavelmente.
Ahh claro, isso é, se o jogo não estiver encriptado. Caso esteja, ai já não sei de nenhuma solução, se não upar o jogo todo novamente.