Bem, experimentei fazer algo semelhante aqui e funcionou. Olhando os seus eventos, imagino que talvez o problema esteja no input pra sentar e levantar, que tá repetido em dois eventos diferentes. Então pode ser que quando você aperte a tecla ele ative/desative as switches ao mesmo tempo.
Tente mudar o evento de sentar colocando o de levantar junto, já que usam a mesma tecla. Basta fazer uma condição pra se "Sentada" estiver ON e dentro dela um comando pra mudar pra OFF, e no else um comando pra mudar pra ON. Desse jeito aqui:

Como dá pra ver, eu só ativei a Switch "Sentado", pois se o evento de mudar de direção e recuperar MP são ativados e desativados juntos não há motivo pra fazer duas Switches diferentes. Então nas condições de ambos os eventos, você pode usar a mesma.
Depois disso basta você ir no evento de troca de direção e remover aquele pedaço do Input, que não vai ser mais necessário. É bom também adicionar um wait de 1 frame no final, pois pelo menos aqui sem o wait eu não conseguia fazer as teclas responderem (já que Início Automático trava o jogo).
Isso já deve fazer o sistema funcionar direito. Agora, algumas recomendaçõezinhas: 60 frames pode ser muito tempo pra esperar o MP recuperar, então pode ser que fique melhor reduzir a quantia de MP recuperada e reduzir o tempo de espera junto. Assim também fica mais fácil pra verificar se o MP está subindo.
Também recomendo colocar uma condição no fim do wait antes de recuperar o HP, pois o evento em processo paralelo ainda pode estar terminando mesmo após a switch que ativa ele ser desligada. Uma condição pra verificar se a Switch está ligada antes de restaurar o MP evita que ele seja recuperado mesmo que a personagem tenha levantado.

Por fim, como dá pra ver no meu evento, eu adicionei uma animaçãozinha de batalha toda vez que o MP recupera. Geralmente não é legal ficar esperando barras encherem durante um jogo, especialmente se você não consegue abrir o menu pra checar. Então colocar um feedback visual enquanto o MP tá sendo recuperado ajudara deixara coisa um pouco menos monótona.
Espero que te ajude, até mais \o