Ah, esse sistema. Você está falando do próprio projétil quando atira? Se sim, o sistema não reconhece objetos/inimigos pelo tamanho do sprite, mas pelo tile onde ele se encontra. Por exemplo, mesmo que o seu gráfico ocupe três tiles, somente aquele onde o evento se encontra é relevante, geralmente o central ou central-inferior.
Você pode tentar o seguinte: na pasta Graphics do seu projeto deve haver uma pasta denominada
Particles. Lá dentro, estas duas imagens são os "tiros":
Você pode redimensioná-las para testar, mas tenho quase certeza de que não vai adiantar muito. Enfim, se eu entendi direito você precisa é de um ABS com colisão por píxels que, infelizmente, não conheço. :( Uma alternativa seria criar pontos de colisão em torno do inimigo, mas prepare-se para um bom trampo.