Então pessoal, acabei de encontrar a solução, na verdade fui descansar um pouco, voltei e pensei mais sobre. Enfim encontrei a solução, vou deixar o código a baixo, caso alguém também esteja estudando já fica minha experiência, se eu tiver mais alguma duvida volto a postar nesse mesmo local.
O detalhe que eu percebi é que não preciso criar uma nova Classe e passar como filho para poder utilizar a mesma janela de que eu precise, apenas eu criei uma instancia.
De qualquer forma essa instancia vem pré-definida, então o que precisei fazer foi adicionar apenas o que eu quis, e nos locais certos.
Meu problema era que não estava criando o conteúdo que avia adicionado, no caso eu esta faltando colocar no Update, as funções de createContents e drawAllItens que são da Classe, para poder fazer atualizar a janela e incluir os itens. Obrigado, e se servir para alguém, ou alguém tiver duvidas sobre só manda pm.
(function(){
scni_map = Scene_Map.prototype.initialize;
Scene_Map.prototype.initialize = function(){
scni_map.call(this);
this.janela = new Window_Command(100,100);
};
scnc_map = Scene_Map.prototype.create;
Scene_Map.prototype.create = function(){
scnc_map.call(this);
this.janela.height = 200;
this.janela.addCommand("Nome", 'teste');
this.janela.addCommand("Nome2", 'teste2');
this.janela.setHandler('teste', true);
};
scns_map = Scene_Map.prototype.start;
Scene_Map.prototype.start = function(){
scns_map.call(this);
this.addWindow(this.janela);
};
scnu_map = Scene_Map.prototype.update;
Scene_Map.prototype.update = function(){
scnu_map.call(this);
this.janela.createContents();
this.janela.drawAllItems();
};
})();
EDIT: Consegui, mas vou ver seu conselho.
Porém ela funcionou e até executou o método.
Eu entendi a forma que você diz, mas eu percebi que para cada classe de Janela eu teria que rodar uma cena, e nesse cado eu estou criando uma unica cena onde varios tipos de janela interagem.
Edit2:
Compreendi melhor, ao inves de criar uma instacia direta de Window_command eu tenho que criar uma jenala filha e depois crislar A instacia dessa janela, entendi! :D. Obrigado ;D