Independentemente do tamanho da sua imagem, qualquer RPG Maker irá reconhecer o evento apenas pelo tamanho padrão do tile, no caso 48x48. Que eu saiba, ainda não foi criado nenhum sistema de colisão por pixels para o MV, o que resolveria seu problema. Porém, você sempre pode fazer gambiarras:
Digamos que um carro tenha o tamanho de dois tiles. Corte o gráfico em quadros do tamanho padrão e crie dois eventos, cada um com uma parte do gráfico. Eu não recomendo que faça isso porque vai pesar seus mapas e dar um trabalho considerável. Citei só para mostrar o que é possível fazer. Recomendo mesmo é que evite usar gráficos muito grandes e, caso use, planeje bem a passabilidade dos mapas de modo que o jogador não possa alcançar essas falhas.