Existem vários métodos.
Você pretende editar o mapa em algum programa externo?
Se não, não há necessidade de nenhum processo complexo para adicionar a iluminação, afinal, basta adicionar apenas ela. Você pode fazer isso pelo comandos de pictures ou através de algum plugin especifico.
Se sim, se você desejar criar a base no maker terá sim que salvá-la em uma imagem para depois editá-la no programa externo de sua escolha (GIMP no seu caso, certo?). Se quiser você também pode fazer o mapa completamente pelo programa externo e só após finalizá-lo importá-lo para engine.
Depois de inserido no projeto você precisará configurar a passabilidade do mapa manualmente. Pode fazer isso com tilesets especificos que devidamente configurados permitem ou proíbem a passagem do personagem no local posicionado, ou então, pode utilizar também as regiões (nesse caso talvez seja necessário algum plugin para especificar a função de cada uma).
Pode parecer complicado de primeiro momento, mas os processos são extremamente simples.