Isso depende muito do script que está usando, já que cada um pode adicionar um punhado de variáveis.
Algumas variáveis são comuns, como é o caso do Graphics.boxWidth que vê, que se refere à largura da tela de desenho do MV. A largura da tela não é igual à resolução do monitor, sendo 800x600 por padrão, esticado para a resolução do seu monitor quando em tela cheia.
Na fórmula 1, por exemplo:
Graphics.boxWidth / 8 + Graphics.boxWidth / 4 * index
É traduzido como:
800 / 8 + 800 / 4 * index
Pela descrição, assumo que o index seja o índice do personagem no grupo — se o grupo tem 4 personagem, cada personagem tem um índice no grupo; 0, 1, 2 e 3. Então para o segundo personagem, a posição horizontal na tela ficaria:
800 / 8 + 800 / 4 * 1
Ou:
100 + 200 * 1
Ou 300. Isso colocaria os 4 personagens horizontalmente em: 0, 300, 600 e 900. Assumo que o último ficaria fora da tela.
O Math.max é uma função do JS que retorna o maior dado N parâmetros. Em:
Math.max(312, Graphics.boxWidth / 4);
Ficaria:
Math.max(312, 800 / 4);
Ou:
Math.max(312, 200);
Ou 312, já que é o maior valor entre os dois. Se ao invés de Graphics.boxWidth / 4, fiséssemos Graphics.boxWidth / 2, ficaria 800 / 2, ou 400. Math.max(312, 400) retornaria 400, pois é o maior valor dos dois.
No terceiro, screenWidth, maxSize e index são relativos ao script. Você pode imaginar o que são, mas apenas sabendo o que o script faz e lendo as instruções temos a visão correta.