Tu tem que adicionar o código abaixo no initialize das janelas que deseja que fique com o fundo sem transparência. Nesse caso, tu deve adicionar essa linha na Window_BattleStatus e na Window_ActorCommand.
self.back_opacity = 255
Deixei dessa forma:
#--------------------------------------------------------------------------
# * Inicialização do objeto
#--------------------------------------------------------------------------
def initialize
self.back_opacity = 255
super(0, 0, window_width, window_height)
refresh
self.openness = 0
end
Mas está dando erro ao iniciar a batalha.

EDIT:
Consegui resolver, só tive que colocar mais abaixo da parte do intialize e depois acrescentar também no script Window_PartyCommand. Vlw Gerar! Vou trancar o tópico

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